1988年医院设立监察审计办公室，2016年更名为审计处。自成立以来，审计处围绕医院中心工作，对本单位及所属单位财政财务收支、经济活动、内部控制、风险管理实施独立、客观的监督、评价和建议，协助医院按现代医院管理要求完善治理，提高医院运营效能，保障医院高质量发展。

现配备有会计、工程造价、经济管理、信息、法律等相关专业人员11名。

主要职责：

审计处按照《审计署关于内部审计工作的规定》（审计署令第11号）、《重庆市内部审计工作办法》（重庆市人民政府令第340号）等有关规定和本单位的要求，履行下列职责：对本单位及所属单位贯彻落实党和国家以及本地区重大政策措施情况，发展规划、战略决策、重大措施以及业务计划执行情况，财政财务收支，固定资产投资项目，自然资源资产管理和生态环境保护责任的履行情况，境外机构、境外资产和境外经济活动，经济管理和效益情况，内部控制及风险管理情况等进行审计；对按照干部管理权限属于本单位管理的单位主要负责人履行经济责任情况进行审计；协助本单位主要负责人督促落实国家审计和内部审计发现问题的整改工作；对本单位所属单位的内部审计工作进行指导、监督和管理；国家有关规定和本单位要求办理的其他审计事项。

处室荣誉：

2020-2022年度全国内部审计先进集体

2014-2016年度全国内部审计先进集体

2011-2013年度全国内部审计先进集体

2005-2007年度重庆市内部审计工作先进集体